MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Caldiarchaeum subterraneum DNA

Total Repeats: 31706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022786	GCT	2	6	68	73	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
2	NC_022786	GAG	2	6	113	118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
3	NC_022786	CTT	2	6	149	154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693446
4	NC_022786	GA	4	8	161	168	50 %	0 %	50 %	0 %	557693446
5	NC_022786	CTTCT	2	10	176	185	0 %	60 %	0 %	40 %	557693446
6	NC_022786	CTTT	2	8	186	193	0 %	75 %	0 %	25 %	557693446
7	NC_022786	GTT	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693446
8	NC_022786	TC	3	6	365	370	0 %	50 %	0 %	50 %	557693446
9	NC_022786	CCG	2	6	390	395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693446
10	NC_022786	GAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
11	NC_022786	CAA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693446
12	NC_022786	CGA	2	6	502	507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693446
13	NC_022786	GAG	2	6	527	532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
14	NC_022786	ATCT	2	8	545	552	25 %	50 %	0 %	25 %	557693446
15	NC_022786	AGC	2	6	563	568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693446
16	NC_022786	GAA	2	6	748	753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693446
17	NC_022786	T	6	6	778	783	0 %	100 %	0 %	0 %	557693446
18	NC_022786	GCT	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
19	NC_022786	AGGA	2	8	803	810	50 %	0 %	50 %	0 %	557693446
20	NC_022786	GCTGAG	2	12	854	865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	557693446
21	NC_022786	CTG	2	6	882	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
22	NC_022786	AGCG	2	8	907	914	25 %	0 %	50 %	25 %	557693446
23	NC_022786	CCA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693446
24	NC_022786	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693446
25	NC_022786	CGG	2	6	981	986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693446
26	NC_022786	GAG	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
27	NC_022786	AGG	2	6	1071	1076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693446
28	NC_022786	TTC	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693446
29	NC_022786	CTT	2	6	1260	1265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693447
30	NC_022786	CGC	3	9	1271	1279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693447
31	NC_022786	CAT	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
32	NC_022786	ATT	2	6	1348	1353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693447
33	NC_022786	CG	3	6	1387	1392	0 %	0 %	50 %	50 %	557693447
34	NC_022786	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	557693447
35	NC_022786	TCA	2	6	1544	1549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
36	NC_022786	GCT	2	6	1661	1666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
37	NC_022786	GTCGAT	2	12	1707	1718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	557693447
38	NC_022786	GC	3	6	1722	1727	0 %	0 %	50 %	50 %	557693447
39	NC_022786	CCT	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693447
40	NC_022786	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693447
41	NC_022786	G	6	6	2018	2023	0 %	0 %	100 %	0 %	557693447
42	NC_022786	CAA	2	6	2051	2056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693447
43	NC_022786	ATG	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693447
44	NC_022786	TCG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
45	NC_022786	TC	3	6	2211	2216	0 %	50 %	0 %	50 %	557693447
46	NC_022786	GA	3	6	2295	2300	50 %	0 %	50 %	0 %	557693447
47	NC_022786	GCT	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693447
48	NC_022786	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	557693447
49	NC_022786	CCAT	2	8	2372	2379	25 %	25 %	0 %	50 %	557693447
50	NC_022786	AGT	2	6	2667	2672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693448
51	NC_022786	ACC	2	6	2751	2756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693448
52	NC_022786	CGT	2	6	2764	2769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
53	NC_022786	GCT	2	6	2805	2810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
54	NC_022786	TCT	2	6	2911	2916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693448
55	NC_022786	CCA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693448
56	NC_022786	TAT	2	6	2990	2995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693448
57	NC_022786	TGT	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693448
58	NC_022786	AGG	2	6	3105	3110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693448
59	NC_022786	GC	3	6	3146	3151	0 %	0 %	50 %	50 %	557693448
60	NC_022786	CT	3	6	3187	3192	0 %	50 %	0 %	50 %	557693448
61	NC_022786	CGT	2	6	3379	3384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693448
62	NC_022786	TGT	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693449
63	NC_022786	GCGAT	2	10	3539	3548	20 %	20 %	40 %	20 %	557693449
64	NC_022786	CCAGCC	2	12	3641	3652	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	557693449
65	NC_022786	TCTGCT	2	12	3665	3676	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	557693449
66	NC_022786	CAC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693449
67	NC_022786	GAA	2	6	3705	3710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693449
68	NC_022786	CGC	2	6	3732	3737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693449
69	NC_022786	GCAT	2	8	3760	3767	25 %	25 %	25 %	25 %	557693449
70	NC_022786	CT	3	6	3773	3778	0 %	50 %	0 %	50 %	557693449
71	NC_022786	CTC	2	6	3786	3791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693449
72	NC_022786	TCTT	2	8	3910	3917	0 %	75 %	0 %	25 %	557693449
73	NC_022786	AGT	3	9	3923	3931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693449
74	NC_022786	TTA	2	6	4103	4108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693449
75	NC_022786	GGA	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693449
76	NC_022786	CCT	2	6	4133	4138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693449
77	NC_022786	AG	3	6	4163	4168	50 %	0 %	50 %	0 %	557693449
78	NC_022786	TGC	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693449
79	NC_022786	TGT	2	6	4232	4237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693450
80	NC_022786	TGC	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693450
81	NC_022786	GT	3	6	4251	4256	0 %	50 %	50 %	0 %	557693450
82	NC_022786	GCG	2	6	4259	4264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693450
83	NC_022786	TGGA	2	8	4307	4314	25 %	25 %	50 %	0 %	557693450
84	NC_022786	GTCT	2	8	4371	4378	0 %	50 %	25 %	25 %	557693450
85	NC_022786	GAA	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693450
86	NC_022786	CGG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693450
87	NC_022786	CCGG	2	8	4656	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	557693451
88	NC_022786	GAC	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693451
89	NC_022786	GAC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693451
90	NC_022786	TCG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693451
91	NC_022786	GCG	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693451
92	NC_022786	GCC	2	6	5073	5078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693451
93	NC_022786	CGG	2	6	5168	5173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693451
94	NC_022786	CGGTG	2	10	5208	5217	0 %	20 %	60 %	20 %	557693452
95	NC_022786	ATT	2	6	5244	5249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557693452
96	NC_022786	CTA	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693452
97	NC_022786	GGT	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693452
98	NC_022786	A	6	6	5405	5410	100 %	0 %	0 %	0 %	557693452
99	NC_022786	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693452
100	NC_022786	CTT	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693452
101	NC_022786	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693452
102	NC_022786	TA	3	6	5522	5527	50 %	50 %	0 %	0 %	557693452
103	NC_022786	CCT	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693452
104	NC_022786	TCC	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693452
105	NC_022786	T	7	7	5718	5724	0 %	100 %	0 %	0 %	557693453
106	NC_022786	AAC	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693453
107	NC_022786	CCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693453
108	NC_022786	GAA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693453
109	NC_022786	CCT	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693453
110	NC_022786	CTCTG	2	10	5923	5932	0 %	40 %	20 %	40 %	557693453
111	NC_022786	CGA	3	9	6031	6039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693453
112	NC_022786	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557693453
113	NC_022786	GCA	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693454
114	NC_022786	CCA	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557693454
115	NC_022786	TGC	2	6	6145	6150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693454
116	NC_022786	GCA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557693454
117	NC_022786	AAC	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693454
118	NC_022786	ACA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557693454
119	NC_022786	TCAA	2	8	6316	6323	50 %	25 %	0 %	25 %	557693454
120	NC_022786	TCA	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693455
121	NC_022786	T	6	6	6358	6363	0 %	100 %	0 %	0 %	557693455
122	NC_022786	GA	3	6	6401	6406	50 %	0 %	50 %	0 %	557693455
123	NC_022786	GATGG	2	10	6464	6473	20 %	20 %	60 %	0 %	557693455
124	NC_022786	TCC	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693455
125	NC_022786	GA	3	6	6583	6588	50 %	0 %	50 %	0 %	557693455
126	NC_022786	GAA	2	6	6630	6635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557693455
127	NC_022786	T	6	6	6812	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	557693456
128	NC_022786	A	6	6	6945	6950	100 %	0 %	0 %	0 %	557693456
129	NC_022786	TCAAGC	2	12	6981	6992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	557693456
130	NC_022786	GGC	2	6	7081	7086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693456
131	NC_022786	TGAGG	2	10	7099	7108	20 %	20 %	60 %	0 %	557693456
132	NC_022786	ATGT	2	8	7136	7143	25 %	50 %	25 %	0 %	557693456
133	NC_022786	GA	3	6	7157	7162	50 %	0 %	50 %	0 %	557693456
134	NC_022786	TCTCC	2	10	7170	7179	0 %	40 %	0 %	60 %	557693456
135	NC_022786	CCG	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
136	NC_022786	CCG	2	6	7294	7299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693457
137	NC_022786	GGC	2	6	7306	7311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693457
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251	NC_022786	TGA	2	6	13002	13007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557693461
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253	NC_022786	GT	3	6	13116	13121	0 %	50 %	50 %	0 %	557693461
254	NC_022786	TCC	2	6	13205	13210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693461
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260	NC_022786	GCG	2	6	13581	13586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693462
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262	NC_022786	GCG	2	6	13642	13647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693462
263	NC_022786	GGA	2	6	13698	13703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693462
264	NC_022786	TGGC	2	8	13714	13721	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
265	NC_022786	GGC	2	6	13724	13729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693462
266	NC_022786	CCT	2	6	13756	13761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557693462
267	NC_022786	TTG	2	6	13780	13785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693462
268	NC_022786	GCTG	2	8	13790	13797	0 %	25 %	50 %	25 %	557693462
269	NC_022786	CGC	2	6	13799	13804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557693462
270	NC_022786	GGA	2	6	13820	13825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557693462
271	NC_022786	GTG	2	6	13884	13889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557693462
272	NC_022786	GCT	2	6	13961	13966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557693462
273	NC_022786	GGC	2	6	14033	14038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557693462
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281	NC_022786	A	7	7	14327	14333	100 %	0 %	0 %	0 %	557693462
282	NC_022786	ATA	2	6	14352	14357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557693462
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290	NC_022786	TG	3	6	14704	14709	0 %	50 %	50 %	0 %	557693463
291	NC_022786	GTT	2	6	14711	14716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693463
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382	NC_022786	TGT	2	6	21318	21323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557693470
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384	NC_022786	GGAA	2	8	21425	21432	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
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387	NC_022786	TACCG	2	10	21492	21501	20 %	20 %	20 %	40 %	557693470
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390	NC_022786	GA	3	6	21691	21696	50 %	0 %	50 %	0 %	557693470
391	NC_022786	CAT	3	9	21734	21742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557693470
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